Constituido en el mes de abril de 1990 a instancias de la Secretaria de Agricultura, Ganadería, Desarrollo Rural, Pesca y Alimentación (SAGARPA), transfiriendo la operación y administración de su infraestructura, personal y equipo para realizar conjuntamente con las Organizaciones de Productores Pecuarios, Autoridades Estatales y Federales los programas y actividades en beneficio de la economía y la salud publica del Estado de Jalisco.
A partir de su conformación se han desarrollado Programas que garantizan la Vigilancia y saneamiento de acuerdo a lo establecido en las normas Nacionales y Estatales.
Los recursos del Comité provienen de un presupuesto conjunto (Federal-Estatal), este es designado para operar los diferentes programas que trabaja, los avances en estos son reportados al SENASICA.